Alors que la fin approche pour le Japon féodal, le shogunat Tokugawa, dynastie de shoguns qui dirigent la contrée depuis 1603, rassemble une équipe d'assassins impitoyables pour défendre ses représentants à Kyoto. Ces hommes sont connus sous le nom de Shinsengumi. Épéistes formidables avec un dévouement sans faille à leur cause, les Shinsengumi ne pensent à rien d'autre qu'à pourfendre leurs ennemis.
Mais que se passe-t-il quand l'ennemi en question appartient au monde des morts-vivants ?