50 ans après les aventures de Hiroshi Shiba et sa victoire sur le diabolique Empire Yamatai, une nouvelle menace pèse sur la Terre.

Kenji Kusanagi,un jeune étudiant et motocycliste aguerrit, devient Koutetsushin Jeeg pour combattre le retour de Haniwa Genjin, provenant du Grand Empire Jama que dirige l'impitoyable reine Himika...