Diffusé le 09/02/1967 - 50 min
L'équipage de l'Enterprise est chargé d'enquêter sur la disparition de l'USS Archon, un vaisseau de la Fédération disparu en 2167. Il s'avère que le vaisseau été détruit par un ordinateur très évolué, nommé Landru, chargé de la gestion et de la protection de la planète.
Diffusé le 16/02/1967 - 50 min
L'Enterprise découvre le vaisseau cryogénique SS Botany Bay, après avoir reçu son appel de détresse automatique. Les habitants de ce vaisseau sont des réfugiés des guerres Eugéniques terrestres de la fin du 20ème siècle. Parmi eux se trouve Khan Noonien Singh, tyran qui a régné sur un quart de la Terre pendant cette période. Après leur échec pour prendre le contrôle de l'Enterprise, Khan et ses complices sont exilés par Kirk sur la planète Ceti Alpha V, sans en informer la Fédération. Le film Star Trek II présente la suite de cette aventure.
Diffusé le 23/02/1967 - 50 min
Kirk est chargé par l'ambassadeur Fox de nouer des liens diplomatiques avec la planète Eminiar VII malgré l'interdiction imposée par Starfleet de prendre contact avec la planète. En effet, celle-ci est en guerre avec la planète voisine par ordinateur interposé. Celui-ci calcule les pertes de cette guerre virtuelle et "euthanasie" les victimes. Peu après l'équipage de l'Enterprise est déclaré "victime" à son tour.
Diffusé le 02/03/1967 - 50 min
Kirk doit enquêter sur une colonie exposée à une forte dose de rayons Berthold. Alors que tous les colons devraient être morts, il apparaît que ceux-ci sont protégés par des spores émis par des fleurs locales.
Diffusé le 09/03/1967 - 50 min
L'équipage est appelé à la rescousse par la colonie minière de Janus VI, dont les mineurs sont décimés par une créature inconnue.
Diffusé le 23/03/1967 - 50 min
L'Enterprise est chargé d'empêcher une invasion des Klingons en défendant la planète Organia. Supposée inhabitée, cette planète abrite une société peu évoluée techniquement. Kirk propose alors son aide aux Organiens pour se défendre contre les Klingons, mais ceux-ci refusent et se laissent envahir. Plus tard, il s'avère que les Organiens sont en réalités une espèce incorporelle très puissante et ils obligent les Klingons à signer un traité de paix avec la Fédération. Ils prédisent de plus que, dans le futur, les deux races deviendront amies, ce qui ne se démentira finalement pas (cf. Star Trek VI).
Diffusé le 30/03/1967 - 51 min
Alors qu'il explore un système inhabité, l'Enterprise subit une violente perturbation spatio-temporelle. La source semble se situer sur une planète de ce système. Kirk y découvre un étrange vaisseau et son pilote : Lazarus.
Diffusé le 06/04/1967 - 50 min
Ayant détecté une perturbation temporelle, l'Enterprise découvre sur une planète les ruines d'une très ancienne civilisation. Parmi ces restes, se trouve le Gardien de l'Éternité: une porte permettant de voyager dans l'espace et le temps. Sous l'emprise d'une drogue prise par erreur, le Dr Mc Coy franchit cette porte et altère la cours du temps.
Diffusé le 13/04/1967 - 50 min
L'Enterprise tente, en vain, de sauver une navette se dirigeant vers le soleil. Comme cette navette provenait de la colonie Deneva, Kirk enquête sur cette planète où réside son frère et sa famille. Toute la planète a été envahie par des parasites responsables de la disparition de trois autres colonies et qui contrôlent leur hôte en s'introduisant dans leur système nerveux.
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