Synopsis

14 ans ont passé depuis le Troisième Impact. Les attaques des anges contre l'humanité continuent.

Shinji Ikari est ramené à la vie et découvre que le monde a changé: la Terre a été ravagée, ses anciens alliés de la NERV lui sont dorénavant hostiles et Rei Ayanami, la fille pour laquelle Shinji a tout risqué, demeure introuvable. Alors qu'il tente de s'adapter à son nouveau monde, Shinji se lie d'amitié avec l'énigmatique Kaworu Nagisa. Recherchant Rei ensemble, les deux amis découvrent les terribles vérités derrière les Anges, la NERV et les Evangelions. Mais une lueur d'espoir continue de briller: une unique chance de rattraper les erreurs du passé.

Dorénavant, les derniers survivants de la race humaine sont contre eux, les Anges feront tout pour les arrêter et leurs anciens amis les considèrent comme les ennemis publics numéro 1. Avec Kaworu pour seul allié et le reste du monde contre lui, Shinji doit lutter pour son unique chance de rédemption. Mais cela pourrait bien s'achever là où tout a commencé: avec la fin du monde...