Synopsis

Joe Shimamura, accusé de meurtre, se retrouve arrêté par les forces de police. Après cette arrestation, c'est le black out total. Il se réveille un jour dans une mystérieuse salle, suite à l'appel d'une petite voix d'enfant dans sa tête qui lui dit de fuir cet endroit. Joe découvre qu'il est en fait dans un laboratoire, qu'il a changé d'apparence, qu'il est un cyborg nommé 009 et que des robots sont chargés de l'empêcher de rejoindre la petite voix. Cette voix, en réalité, est celle de 001, le leader d'un groupe de 8 cyborgs dissidents qui ont fuit le laboratoire eux aussi ; 009 est donc le dernier des cyborgs en captivité.